酱油相比酒和醋，产品浓度和浊度更高，因此对膜分离的连续性，膜污染和膜堵塞的防治，膜分离的经济性是一个挑战。
从1997年开始进行酱油规模化分离的应用，依据应用中反映的问题，进行不断的设备改进。并选择了国内不同原料和工艺的酱油进行了膜分离的中试实验，积累了丰富的膜材料选择、孔径控制、流量设计、污染控制、清洗方法等原始数据。目前除老抽类酱油因焦糖色的原因尚不能应用成熟外，其余低温高稀工艺酱油、天然晒制工艺酱油或固态发酵酱油，均能实现规模化的生产应用。例：福建金冠元调味品公司，应用于瓶装酱油的澄清和除菌，酱油类型为高稀母子酱油和固态淋油，设备选型为CLM-1型全自动错流膜除菌微滤系统（工程塑料型），投产日期为1997年4月。
原工艺流程为：酱油→勾兑→加热至85-90℃→保温2天左右→装瓶→成品
原工艺缺点：灭菌效果不理想，只能达到1000-2000个/ml左右，保温时间过长，不仅影响生产效率，也导致产品口感质量降低，颜色发黑，产品沉淀严重。
新工艺流程为：酱油→勾兑→膜过滤→装瓶→成品
新工艺优点：灭菌效果好，能达到100个/ml以下，无高温加热过程，不仅产品色香味更佳，也节约了可观的能源支出。酱油通过膜过滤后色泽更红润，体态澄清，无沉淀及杂质。
设备运行状态：设备自2003年4月起一直运行，2001年我们又依据运行情况进行了改进，改进后表现为通量稳定性更好，产品浓缩比由90%提高到95%以上（约3-5%的浓缩酱油需要重新进行压滤后再膜过滤），该设备为隔天间歇性运行，每次处理总量约为4吨左右，目前第二套膜正在正常使用中。经统计，膜过滤每吨酱油的费用在7-8元左右。
附：膜过滤前后酱油理化及微生物指标对照：
表一、低盐固态二级酱油膜过滤前后指标变化
指标
滤前
滤后
氨基酸态氮（g/100ML）
0.588
0.588
总氮（g/100ML）
1.141
1.127
无盐固形物（g/100ML）
14.86
14.69
总固形物（g/100ML）
30.2
29.74
氯化钠（g/100ML）
15.34
15.05
总酸（g/100ML）
1.665
1.71
菌落总数
>70000
100
表二、高盐稀态母子酱油膜过滤前后指标变化
指标
滤前
滤后
氨基酸态氮（g/100ML）
0.64
0.64
总氮（g/100ML）
1.15
1.15
无盐固形物（g/100ML）
17.92
17.42
总固形物（g/100ML）
33.1
32.6
氯化钠（g/100ML）
15.18
15.18
总酸（g/100ML）
1.67
1.69
还原糖（g/100ML）
8.27
8.14
菌落总数
>30000
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